抗カルジオリピン抗体・抗β2グリコプロテインI抗体・ホスファチジルセリン依存性抗プロトロンビン抗体 anticardiolipin antibody (aCL) ･ anti-β2-glycoprotein I antibody (a-β2GPI) ･ phosphatidylserine-dependent anti-prothrombin antibody (aPS/PT)

aCLおよびaβ2GPIは、ELISA法により定量的に検出されてきた。当初はリン脂質であるカルジオリピンがaCLの直接の対応抗原と考えられていたが、現在では APS と関連した aCL と、ポリクローナルB細胞活性化を伴う膠原病（APSを合併しないSLEやシェーグレン症候群）や感染症患者にみられる非特異的な aCL は、真の対応抗原の違いにより区別されうることがわかっている。すなわち、APS 患者に検出される aCL はカルジオリピンとβ2GPIとの複合体に結合しており、しかもその結合エピトープはβ2GPI の分子上に存在する。つまり、aCLおよびaβ2GPIは、本質的には同一抗体群を異なる固相化検査で検出していることになるが、クローナリティの違いから両者を同時に検討することが重要である。我が国では両抗体のIgG/IgMを同時に測定するパネル検査が保険収載されている。また、β2GPI依存性抗カルジオリピン抗体と呼ばれるアッセイはAPSに特異性が高いと言えるが、我が国でのみ用いられる検査であることに注意が必要である。

β2GPIと並ぶ主要な抗リン脂質抗体の対応抗原がプロトロンビンである。ホスファチジルセリンを固相化、プロトロンビンを吸着して抗原としたものを用いてELISAをおこなうと（ホスファチジルセリン依存性抗プロトロンビン抗体：aPS/PT）、APSの臨床症状と非常に強い相関があることが示された。aPS/PTはAPSの補助診断として用いる。

近年、化学発光免疫測定法（CLIA）、化学発光酵素免疫測定法（CLEIA）、および蛍光免疫測定法（FIA）を測定原理とする検査法が保険収載され、普及しつつある。これらの検査では、APS分類基準に採用されている4種類の抗リン脂質抗体（aCL ／aβ2GPI IgG・IgM）を同時に測定することが可能である。